Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 RPP1YHR062C 882 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 AIM24YJR080C 1185 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 YLR123CYLR123C 330 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 AGP2YBR132C 1791 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 SGE1YPR198W 1632 nt6.43□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF2Q12221 AAT2YLR027C 1257 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 RPS3YNL178W 723 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 UTR2YEL040W 1404 nt6.42□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF2Q12221 RQC1YDR333C 2172 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 MAK32YCR019W 1092 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 TRR1YDR353W 960 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 MED6YHR058C 888 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 TSR3YOR006C 942 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 RPS28AYOR167C 204 nt6.4□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF2Q12221 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 DOT5YIL010W 648 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 RKI1YOR095C 777 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 POX1YGL205W 2247 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 CRF1YDR223W 1404 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 YPR204WYPR204W 3099 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 HRQ1YDR291W 3234 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 ECM14YHR132C 1293 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 COQ3YOL096C 939 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 LYS21YDL131W 1323 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 CIT3YPR001W 1461 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 GFA1YKL104C 2154 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 ILV1YER086W 1731 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 PEX3YDR329C 1326 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 LCB3YJL134W 1230 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 MOG1YJR074W 657 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 ZRT2YLR130C 1269 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 QRI5YLR204W 336 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 COX5AYNL052W 462 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 RIX7YLL034C 2514 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 MAK31YCR020C-A 267 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 TMT1YER175C 900 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 EHD3YDR036C 1503 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 SES1YDR023W 1389 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 YET3YDL072C 612 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 YDL218WYDL218W 954 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 YDR015CYDR015C 240 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 HSP12YFL014W 330 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 YNL285WYNL285W 372 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 KTR1YOR099W 1182 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 MCH1YDL054C 1461 nt6.34□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 IVY1YDR229W 1362 nt6.34□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 SHO1YER118C 1104 nt6.34□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF2Q12221 QCR8YJL166W 285 nt6.34□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 ECM38YLR299W 1983 nt6.34□□□□□ -1.39
PUF2Q12221 IES2YNL215W 963 nt6.33□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 YTP1YNL237W 1380 nt6.32□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 ERG12YMR208W 1332 nt6.32□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 SWP1YMR149W 861 nt6.32□□□□□ -1.4 RIP-Chip
PUF2Q12221 SMK1YPR054W 1167 nt6.32□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 BDF2YDL070W 1917 nt6.31□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 EMP65YER140W 1671 nt6.31□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 JNM1YMR294W 1122 nt6.31□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 YBR226CYBR226C 411 nt6.31□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 YLL067CYLL067C 3618 nt6.3□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 ICL1YER065C 1674 nt6.3□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 TIM22YDL217C 624 nt6.3□□□□□ -1.4 RIP-Chip
PUF2Q12221 POP5YAL033W 522 nt6.3□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 NHA1YLR138W 2958 nt6.3□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 DAL4YIR028W 1908 nt6.3□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 FRE5YOR384W 2085 nt6.3□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 CDC16YKL022C 2523 nt6.3□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 ARG81YML099C 2643 nt6.29□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 RGT2YDL138W 2292 nt6.29□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 SNU71YGR013W 1863 nt6.29□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 BUD32YGR262C 786 nt6.29□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 YHM2YMR241W 945 nt6.29□□□□□ -1.4 RIP-Chip
PUF2Q12221 CAF40YNL288W 1122 nt6.29□□□□□ -1.4 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOR389WYOR389W 1875 nt6.29□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 UIP4YPL186C 915 nt6.29□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 TKL2YBR117C 2046 nt6.29□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 EXG1YLR300W 1347 nt6.28□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 PGM1YKL127W 1713 nt6.28□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 GPA1YHR005C 1419 nt6.28□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 YIR042CYIR042C 711 nt6.28□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 RPS5YJR123W 678 nt6.28□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 RRN10YBL025W 438 nt6.28□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 YMC1YPR058W 924 nt6.28□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 YCK1YHR135C 1617 nt6.28□□□□□ -1.4
PUF2Q12221 YJL211CYJL211C 444 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 SUR7YML052W 909 nt6.27□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF2Q12221 RRS1YOR294W 612 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 ARP3YJR065C 1350 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 CDC34YDR054C 888 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 GCV3YAL044C 513 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 ECM19YLR390W 339 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 YPL102CYPL102C 303 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 EEB1YPL095C 1371 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 UTP4YDR324C 2331 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 PYC2YBR218C 3543 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 BUR6YER159C 429 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 RPL21AYBR191W 483 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 CRP1YHR146W 1398 nt6.25□□□□□ -1.41 RIP-Chip
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