Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD4P55036 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD4P55036 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD4P55036 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMD4P55036 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms