Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNA4P52798 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms