Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRKP46108 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRKP46108 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRKP46108 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRKP46108 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRKP46108 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRKP46108 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRKP46108 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRKP46108 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRKP46108 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRKP46108 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRKP46108 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRKP46108 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRKP46108 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRKP46108 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRKP46108 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRKP46108 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRKP46108 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRKP46108 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRKP46108 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRKP46108 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRKP46108 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRKP46108 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRKP46108 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRKP46108 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRKP46108 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRKP46108 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRKP46108 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRKP46108 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRKP46108 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRKP46108 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRKP46108 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRKP46108 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRKP46108 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRKP46108 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRKP46108 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRKP46108 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRKP46108 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CRKP46108 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRKP46108 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRKP46108 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRKP46108 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRKP46108 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRKP46108 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRKP46108 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRKP46108 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRKP46108 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRKP46108 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRKP46108 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRKP46108 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CRKP46108 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CRKP46108 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CRKP46108 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CRKP46108 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CRKP46108 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRKP46108 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRKP46108 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRKP46108 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRKP46108 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRKP46108 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRKP46108 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRKP46108 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRKP46108 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRKP46108 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRKP46108 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CRKP46108 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRKP46108 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRKP46108 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRKP46108 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRKP46108 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRKP46108 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CRKP46108 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRKP46108 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRKP46108 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRKP46108 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRKP46108 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRKP46108 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRKP46108 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CRKP46108 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRKP46108 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRKP46108 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRKP46108 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CRKP46108 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRKP46108 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CRKP46108 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRKP46108 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRKP46108 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CRKP46108 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRKP46108 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRKP46108 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRKP46108 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRKP46108 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms