Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC12P31275 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC12P31275 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC12P31275 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC12P31275 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC12P31275 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC12P31275 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC12P31275 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC12P31275 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC12P31275 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC12P31275 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC12P31275 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC12P31275 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC12P31275 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC12P31275 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC12P31275 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC12P31275 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC12P31275 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC12P31275 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC12P31275 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC12P31275 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC12P31275 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC12P31275 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC12P31275 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC12P31275 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC12P31275 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms