Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN4P29074 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN4P29074 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN4P29074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN4P29074 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN4P29074 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN4P29074 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN4P29074 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN4P29074 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms