Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL3P19876 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CXCL3P19876 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms