Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLOCKO15516 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLOCKO15516 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms