Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC3O15234 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASC3O15234 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC3O15234 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC3O15234 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC3O15234 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC3O15234 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC3O15234 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC3O15234 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC3O15234 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASC3O15234 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASC3O15234 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC3O15234 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC3O15234 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC3O15234 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC3O15234 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASC3O15234 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASC3O15234 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC3O15234 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC3O15234 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC3O15234 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC3O15234 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC3O15234 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASC3O15234 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASC3O15234 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASC3O15234 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC3O15234 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC3O15234 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC3O15234 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC3O15234 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC3O15234 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC3O15234 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASC3O15234 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC3O15234 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC3O15234 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC3O15234 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC3O15234 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC3O15234 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASC3O15234 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC3O15234 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC3O15234 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC3O15234 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC3O15234 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC3O15234 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASC3O15234 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC3O15234 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC3O15234 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC3O15234 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC3O15234 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC3O15234 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC3O15234 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC3O15234 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC3O15234 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC3O15234 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC3O15234 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC3O15234 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC3O15234 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC3O15234 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC3O15234 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC3O15234 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC3O15234 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC3O15234 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC3O15234 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC3O15234 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms