Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL33A6NCF5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL33A6NCF5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL33A6NCF5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL33A6NCF5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms