Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R4GMQ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R4GMQ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R4GMQ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R4GMQ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
R4GMQ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
R4GMQ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
R4GMQ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
R4GMQ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R4GMQ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R4GMQ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
R4GMQ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
R4GMQ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R4GMQ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R4GMQ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.27■■□□□ 1
R4GMQ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R4GMQ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
R4GMQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
R4GMQ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
R4GMQ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
R4GMQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
R4GMQ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R4GMQ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R4GMQ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R4GMQ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R4GMQ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R4GMQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R4GMQ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R4GMQ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R4GMQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R4GMQ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
R4GMQ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
R4GMQ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R4GMQ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R4GMQ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
R4GMQ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R4GMQ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R4GMQ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R4GMQ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R4GMQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R4GMQ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R4GMQ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R4GMQ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
R4GMQ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R4GMQ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R4GMQ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R4GMQ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
R4GMQ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R4GMQ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R4GMQ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R4GMQ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R4GMQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
R4GMQ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R4GMQ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
R4GMQ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
R4GMQ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
R4GMQ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R4GMQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R4GMQ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R4GMQ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R4GMQ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R4GMQ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R4GMQ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R4GMQ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R4GMQ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R4GMQ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R4GMQ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R4GMQ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R4GMQ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R4GMQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R4GMQ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R4GMQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R4GMQ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R4GMQ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R4GMQ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R4GMQ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R4GMQ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R4GMQ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R4GMQ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
R4GMQ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R4GMQ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R4GMQ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R4GMQ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R4GMQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R4GMQ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R4GMQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R4GMQ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R4GMQ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R4GMQ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R4GMQ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R4GMQ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R4GMQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R4GMQ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms