Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAPGEF2Q9Y4G8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.03
RAPGEF2Q9Y4G8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAPGEF2Q9Y4G8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.02■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms