Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINS2Q9Y248 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GINS2Q9Y248 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINS2Q9Y248 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GINS2Q9Y248 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms