Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC3Q9UHC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC3Q9UHC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ASIC3Q9UHC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC3Q9UHC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms