Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms