Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX05

FAM120C, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120CQ9NX05 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM120CQ9NX05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM120CQ9NX05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FAM120CQ9NX05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms