Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF19Q9NS68 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF19Q9NS68 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms