Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST12Q9NRB3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHST12Q9NRB3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms