Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM49AQ9H0Q0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM49AQ9H0Q0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM49AQ9H0Q0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM49AQ9H0Q0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms