Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLIRPQ9GZT3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms