Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms