Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFXN3Q9BWM7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN3Q9BWM7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN3Q9BWM7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN3Q9BWM7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms