Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS4Q9BRT9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GINS4Q9BRT9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms