Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEDD1Q8NHV4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEDD1Q8NHV4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEDD1Q8NHV4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms