Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBEAQ8NFP9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBEAQ8NFP9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBEAQ8NFP9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBEAQ8NFP9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBEAQ8NFP9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBEAQ8NFP9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBEAQ8NFP9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBEAQ8NFP9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBEAQ8NFP9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBEAQ8NFP9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms