Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC3Q6UUV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC3Q6UUV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTC3Q6UUV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms