Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MALRD1Q5VYJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MALRD1Q5VYJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MALRD1Q5VYJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms