Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q5VSD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q5VSD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q5VSD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q5VSD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q5VSD8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q5VSD8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q5VSD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q5VSD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q5VSD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q5VSD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q5VSD8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q5VSD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q5VSD8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q5VSD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q5VSD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q5VSD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q5VSD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q5VSD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q5VSD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q5VSD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q5VSD8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q5VSD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q5VSD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q5VSD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q5VSD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q5VSD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q5VSD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q5VSD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q5VSD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q5VSD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q5VSD8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q5VSD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q5VSD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q5VSD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q5VSD8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q5VSD8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q5VSD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q5VSD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q5VSD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q5VSD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q5VSD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q5VSD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q5VSD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q5VSD8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q5VSD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q5VSD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms