Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARHGAP29Q52LW3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGAP29Q52LW3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP29Q52LW3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms