Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRFIP1Q32MZ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRFIP1Q32MZ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRFIP1Q32MZ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRFIP1Q32MZ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms