Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIK5Q16478 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIK5Q16478 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIK5Q16478 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
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