Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBE4AQ14139 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE4AQ14139 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
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UBE4AQ14139 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE4AQ14139 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE4AQ14139 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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