Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM28Q13263 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM28Q13263 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRIM28Q13263 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRIM28Q13263 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRIM28Q13263 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRIM28Q13263 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM28Q13263 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM28Q13263 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM28Q13263 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
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