Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 YBR284WYBR284W 2394 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YRB2YIL063C 984 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 EFM3YJR129C 1020 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 SML1YML058W 315 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YOL046CYOL046C 675 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YML133CYML133C 4125 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 KEL1YHR158C 3495 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 BUD20YLR074C 501 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YML083CYML083C 1257 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 KTR1YOR099W 1182 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 PRP24YMR268C 1335 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YOL036WYOL036W 2286 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 PUP2YGR253C 783 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 LYS1YIR034C 1122 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 LCB3YJL134W 1230 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 OAC1YKL120W 975 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YAR064WYAR064W 300 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 ARE2YNR019W 1929 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 PYK2YOR347C 1521 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 EDC2YER035W 438 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 TMT1YER175C 900 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 AIM46YHR199C 933 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 RNH1YMR234W 1047 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 RUF23RUF23 254 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 RPL21AYBR191W 483 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 ASR1YPR093C 867 nt5.65□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 MRC1YCL061C 3291 nt5.65□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 ACS1YAL054C 2142 nt5.65□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 PRY3YJL078C 2646 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 CYC8YBR112C 2901 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 PPH21YDL134C 1110 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 LAG2YOL025W 1983 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 EFT2YDR385W 2529 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 EFT1YOR133W 2529 nt5.64□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 ESC8YOL017W 2145 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 MEH1YKR007W 555 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 ZIM17YNL310C 525 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 ECM31YBR176W 939 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 SGE1YPR198W 1632 nt5.63□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 RMD9YGL107C 1941 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 VMA3YEL027W 483 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 POP5YAL033W 522 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 YPR123CYPR123C 435 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 YTP1YNL237W 1380 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 AFG1YEL052W 1530 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 VPS5YOR069W 2028 nt5.62□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 RSA4YCR072C 1548 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 CTF19YPL018W 1110 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 SMC5YOL034W 3282 nt5.61□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 CCT8YJL008C 1707 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 CNE1YAL058W 1509 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 PGK1YCR012W 1251 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 YOX1YML027W 1158 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 DAP1YPL170W 459 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 PRP2YNR011C 2631 nt5.6□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 CRH1YGR189C 1524 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 YGL235WYGL235W 537 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 SRL2YLR082C 1179 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 RPS28AYOR167C 204 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 ADE17YMR120C 1779 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 PYC2YBR218C 3543 nt5.59□□□□□ -1.51
ATG41Q12048 AMD2YDR242W 1650 nt5.59□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 PET112YBL080C 1626 nt5.59□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 FMP40YPL222W 2067 nt5.59□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 LAT1YNL071W 1449 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 snR82snR82 268 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 GTO3YMR251W 1101 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 MSO1YNR049C 633 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 LSC1YOR142W 990 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 PTC4YBR125C 1182 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 YFL042CYFL042C 2025 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 KTR5YNL029C 1569 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 COX15YER141W 1461 nt5.58□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 PPT1YGR123C 1542 nt5.57□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 VPS4YPR173C 1314 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 MTC5YDR128W 3447 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 ATG22YCL038C 1587 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 MRS1YIR021W 1092 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 MRPS12YNR036C 462 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 YOL163WYOL163W 510 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 YMC1YPR058W 924 nt5.56□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 EXG1YLR300W 1347 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 HAS1YMR290C 1518 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 YDR387CYDR387C 1668 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 MNN5YJL186W 1761 nt5.55□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 PAT1YCR077C 2391 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 RPR1RPR1 369 nt5.54□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 TEP1YNL128W 1305 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 CLB2YPR119W 1476 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 YCK1YHR135C 1617 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 ASF1YJL115W 840 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 LDB7YBL006C 543 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 VMA4YOR332W 702 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 IVY1YDR229W 1362 nt5.53□□□□□ -1.52
ATG41Q12048 GPD2YOL059W 1323 nt5.52□□□□□ -1.53
ATG41Q12048 PTC3YBL056W 1407 nt5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 122.5 ms