Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSTF1Q05048 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSTF1Q05048 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms