Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD23AP54725 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD23AP54725 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms