Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 TOK1YJL093C 2076 nt10.26□□□□□ -0.77
SSK2P53599 ADY2YCR010C 852 nt10.26□□□□□ -0.77
SSK2P53599 KTR3YBR205W 1215 nt10.26□□□□□ -0.77
SSK2P53599 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.26□□□□□ -0.77
SSK2P53599 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.26□□□□□ -0.77
SSK2P53599 HEM1YDR232W 1647 nt10.25□□□□□ -0.77
SSK2P53599 YCR041WYCR041W 333 nt10.25□□□□□ -0.77
SSK2P53599 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt10.25□□□□□ -0.77
SSK2P53599 SSP120YLR250W 705 nt10.24□□□□□ -0.77
SSK2P53599 YGL036WYGL036W 2730 nt10.24□□□□□ -0.77
SSK2P53599 TOD6YBL054W 1578 nt10.24□□□□□ -0.77
SSK2P53599 ERS1YCR075C 783 nt10.23□□□□□ -0.77
SSK2P53599 BUG1YDL099W 1026 nt10.23□□□□□ -0.77
SSK2P53599 ADE12YNL220W 1302 nt10.23□□□□□ -0.77
SSK2P53599 RIX7YLL034C 2514 nt10.22□□□□□ -0.77
SSK2P53599 RGD2YFL047W 2145 nt10.22□□□□□ -0.77
SSK2P53599 DYS1YHR068W 1164 nt10.22□□□□□ -0.77
SSK2P53599 AIM2YAL049C 741 nt10.22□□□□□ -0.77
SSK2P53599 YML012C-AYML012C-A 378 nt10.22□□□□□ -0.77
SSK2P53599 CIN4YMR138W 576 nt10.22□□□□□ -0.77
SSK2P53599 YNL120CYNL120C 486 nt10.21□□□□□ -0.78
SSK2P53599 YOR012WYOR012W 414 nt10.21□□□□□ -0.78
SSK2P53599 MSY1YPL097W 1479 nt10.2□□□□□ -0.78
SSK2P53599 LDB18YLL049W 540 nt10.2□□□□□ -0.78
SSK2P53599 MET30YIL046W 1923 nt10.2□□□□□ -0.78
SSK2P53599 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt10.19□□□□□ -0.78
SSK2P53599 SPE4YLR146C 903 nt10.19□□□□□ -0.78
SSK2P53599 PNP1YLR209C 936 nt10.18□□□□□ -0.78
SSK2P53599 GNP1YDR508C 1992 nt10.18□□□□□ -0.78
SSK2P53599 SPO7YAL009W 780 nt10.17□□□□□ -0.78
SSK2P53599 ECM31YBR176W 939 nt10.17□□□□□ -0.78
SSK2P53599 MDL2YPL270W 2322 nt10.16□□□□□ -0.78
SSK2P53599 ADE17YMR120C 1779 nt10.16□□□□□ -0.78
SSK2P53599 NUP84YDL116W 2181 nt10.16□□□□□ -0.78
SSK2P53599 YLR312CYLR312C 1197 nt10.15□□□□□ -0.78
SSK2P53599 SEC24YIL109C 2781 nt10.15□□□□□ -0.78
SSK2P53599 PRB1YEL060C 1908 nt10.15□□□□□ -0.78
SSK2P53599 YTP1YNL237W 1380 nt10.15□□□□□ -0.78
SSK2P53599 COX20YDR231C 618 nt10.14□□□□□ -0.79
SSK2P53599 YOR342CYOR342C 960 nt10.14□□□□□ -0.79
SSK2P53599 FRE5YOR384W 2085 nt10.14□□□□□ -0.79
SSK2P53599 PEX31YGR004W 1389 nt10.14□□□□□ -0.79
SSK2P53599 SEC13YLR208W 894 nt10.14□□□□□ -0.79
SSK2P53599 PRC1YMR297W 1599 nt10.13□□□□□ -0.79
SSK2P53599 PHB1YGR132C 864 nt10.13□□□□□ -0.79
SSK2P53599 RPR2YIR015W 435 nt10.13□□□□□ -0.79
SSK2P53599 AIM33YML087C 939 nt10.13□□□□□ -0.79
SSK2P53599 YER137CYER137C 447 nt10.12□□□□□ -0.79
SSK2P53599 ARG1YOL058W 1263 nt10.12□□□□□ -0.79
SSK2P53599 HBN1YCL026C-B 582 nt10.12□□□□□ -0.79
SSK2P53599 SSO1YPL232W 873 nt10.11□□□□□ -0.79
SSK2P53599 YDL119CYDL119C 924 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 DAL3YIR032C 588 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 MEH1YKR007W 555 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 YEL023CYEL023C 2049 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 TPO3YPR156C 1869 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 AQR1YNL065W 1761 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 GEF1YJR040W 2340 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 CCT3YJL014W 1605 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 YJL045WYJL045W 1905 nt10.1□□□□□ -0.79
SSK2P53599 CHA1YCL064C 1083 nt10.09□□□□□ -0.79
SSK2P53599 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt10.09□□□□□ -0.79
SSK2P53599 SQT1YIR012W 1296 nt10.09□□□□□ -0.79
SSK2P53599 RRS1YOR294W 612 nt10.09□□□□□ -0.79
SSK2P53599 MRPS5YBR251W 924 nt10.09□□□□□ -0.79
SSK2P53599 YDL129WYDL129W 876 nt10.08□□□□□ -0.8
SSK2P53599 YPT1YFL038C 621 nt10.08□□□□□ -0.8
SSK2P53599 PYK2YOR347C 1521 nt10.08□□□□□ -0.8
SSK2P53599 PXL1YKR090W 2121 nt10.07□□□□□ -0.8
SSK2P53599 YRF1-2YER190W 5046 nt10.07□□□□□ -0.8
SSK2P53599 MRP17YKL003C 396 nt10.07□□□□□ -0.8
SSK2P53599 FBA1YKL060C 1080 nt10.07□□□□□ -0.8
SSK2P53599 MIA40YKL195W 1212 nt10.06□□□□□ -0.8
SSK2P53599 SFP1YLR403W 2052 nt10.06□□□□□ -0.8
SSK2P53599 COR1YBL045C 1374 nt10.05□□□□□ -0.8
SSK2P53599 YDL057WYDL057W 987 nt10.05□□□□□ -0.8
SSK2P53599 UGX2YDL169C 672 nt10.05□□□□□ -0.8
SSK2P53599 YDR415CYDR415C 1125 nt10.05□□□□□ -0.8
SSK2P53599 UFD1YGR048W 1086 nt10.05□□□□□ -0.8
SSK2P53599 PKC1YBL105C 3456 nt10.05□□□□□ -0.8
SSK2P53599 GPB2YAL056W 2643 nt10.04□□□□□ -0.8
SSK2P53599 TMT1YER175C 900 nt10.04□□□□□ -0.8
SSK2P53599 EXG1YLR300W 1347 nt10.03□□□□□ -0.8
SSK2P53599 AFG1YEL052W 1530 nt10.03□□□□□ -0.8
SSK2P53599 AIM34YMR003W 597 nt10.03□□□□□ -0.8
SSK2P53599 AAD15YOL165C 432 nt10.03□□□□□ -0.8
SSK2P53599 RKI1YOR095C 777 nt10.02□□□□□ -0.81
SSK2P53599 LCB3YJL134W 1230 nt10.01□□□□□ -0.81
SSK2P53599 GCN3YKR026C 918 nt10.01□□□□□ -0.81
SSK2P53599 POP5YAL033W 522 nt10.01□□□□□ -0.81
SSK2P53599 YJR107WYJR107W 987 nt10.01□□□□□ -0.81
SSK2P53599 EFM4YIL064W 774 nt10□□□□□ -0.81
SSK2P53599 MRK1YDL079C 1506 nt10□□□□□ -0.81
SSK2P53599 MET2YNL277W 1461 nt9.99□□□□□ -0.81
SSK2P53599 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt9.99□□□□□ -0.81
SSK2P53599 ASK1YKL052C 879 nt9.99□□□□□ -0.81
SSK2P53599 TOS6YNL300W 309 nt9.99□□□□□ -0.81
SSK2P53599 DAP1YPL170W 459 nt9.99□□□□□ -0.81
SSK2P53599 AIM24YJR080C 1185 nt9.98□□□□□ -0.81
SSK2P53599 ATG12YBR217W 561 nt9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 82.4 ms