Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALDH1A3P47895 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALDH1A3P47895 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms