Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-EP13747 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLA-EP13747 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-EP13747 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms