Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEFMP07197 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEFMP07197 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEFMP07197 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEFMP07197 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEFMP07197 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NEFMP07197 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEFMP07197 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEFMP07197 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEFMP07197 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NEFMP07197 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEFMP07197 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEFMP07197 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEFMP07197 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEFMP07197 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEFMP07197 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEFMP07197 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEFMP07197 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEFMP07197 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFMP07197 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFMP07197 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFMP07197 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFMP07197 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFMP07197 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFMP07197 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFMP07197 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEFMP07197 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEFMP07197 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEFMP07197 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEFMP07197 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NEFMP07197 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NEFMP07197 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NEFMP07197 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NEFMP07197 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEFMP07197 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEFMP07197 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEFMP07197 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEFMP07197 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEFMP07197 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFMP07197 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFMP07197 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFMP07197 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFMP07197 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFMP07197 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEFMP07197 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFMP07197 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFMP07197 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFMP07197 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFMP07197 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFMP07197 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFMP07197 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFMP07197 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEFMP07197 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEFMP07197 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEFMP07197 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEFMP07197 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEFMP07197 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEFMP07197 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEFMP07197 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEFMP07197 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEFMP07197 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEFMP07197 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFMP07197 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFMP07197 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFMP07197 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFMP07197 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFMP07197 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEFMP07197 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEFMP07197 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEFMP07197 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEFMP07197 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEFMP07197 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEFMP07197 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEFMP07197 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEFMP07197 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFMP07197 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFMP07197 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFMP07197 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFMP07197 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFMP07197 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFMP07197 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEFMP07197 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFMP07197 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFMP07197 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFMP07197 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFMP07197 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFMP07197 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFMP07197 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEFMP07197 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEFMP07197 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEFMP07197 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEFMP07197 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NEFMP07197 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NEFMP07197 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFMP07197 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFMP07197 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFMP07197 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFMP07197 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFMP07197 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFMP07197 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms