Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGRP06401 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGRP06401 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGRP06401 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGRP06401 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGRP06401 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGRP06401 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGRP06401 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGRP06401 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGRP06401 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGRP06401 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PGRP06401 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGRP06401 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGRP06401 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGRP06401 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGRP06401 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGRP06401 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGRP06401 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGRP06401 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGRP06401 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGRP06401 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGRP06401 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGRP06401 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGRP06401 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGRP06401 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGRP06401 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGRP06401 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGRP06401 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGRP06401 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGRP06401 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGRP06401 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGRP06401 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGRP06401 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGRP06401 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGRP06401 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGRP06401 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGRP06401 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGRP06401 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGRP06401 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGRP06401 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGRP06401 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGRP06401 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGRP06401 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGRP06401 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGRP06401 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PGRP06401 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGRP06401 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PGRP06401 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGRP06401 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGRP06401 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGRP06401 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGRP06401 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGRP06401 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGRP06401 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGRP06401 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGRP06401 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGRP06401 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGRP06401 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PGRP06401 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGRP06401 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PGRP06401 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGRP06401 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGRP06401 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGRP06401 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGRP06401 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGRP06401 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGRP06401 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGRP06401 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGRP06401 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGRP06401 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGRP06401 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGRP06401 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGRP06401 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGRP06401 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGRP06401 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms