Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC1O14908 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIPC1O14908 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GIPC1O14908 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms