Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRMT12Q53H54 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms