RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330682.2

ELOA3-201, Transcript of elongin A3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene ELOA3, Length 1,877 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3-201ENST00000330682 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.99■■■■□ 3.99
ELOA3-201ENST00000330682 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.86■■■■□ 3.17
ELOA3-201ENST00000330682 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
ELOA3-201ENST00000330682 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.08■■■□□ 2.89
ELOA3-201ENST00000330682 ABCC9O60706 1549 aa32.89■■■□□ 2.86
ELOA3-201ENST00000330682 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.89■■■□□ 2.86
ELOA3-201ENST00000330682 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.68■■■□□ 2.82
ELOA3-201ENST00000330682 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.58■■■□□ 2.81
ELOA3-201ENST00000330682 NACADO15069 1562 aa32.44■■■□□ 2.78
ELOA3-201ENST00000330682 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.14■■■□□ 2.74
ELOA3-201ENST00000330682 SCRIBQ14160 1630 aa32.03■■■□□ 2.72
ELOA3-201ENST00000330682 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.57■■■□□ 2.65
ELOA3-201ENST00000330682 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
ELOA3-201ENST00000330682 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.24■■■□□ 2.59
ELOA3-201ENST00000330682 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.08■■■□□ 2.57
ELOA3-201ENST00000330682 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
ELOA3-201ENST00000330682 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.56
ELOA3-201ENST00000330682 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.9■■■□□ 2.54
ELOA3-201ENST00000330682 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
ELOA3-201ENST00000330682 SMARCA4P51532 1647 aa30.74■■■□□ 2.51
ELOA3-201ENST00000330682 WIZO95785 1651 aa30.65■■■□□ 2.5
ELOA3-201ENST00000330682 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.39■■■□□ 2.46
ELOA3-201ENST00000330682 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
ELOA3-201ENST00000330682 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
ELOA3-201ENST00000330682 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.22■■■□□ 2.43
ELOA3-201ENST00000330682 SMARCA2P51531 1590 aa30.18■■■□□ 2.42
ELOA3-201ENST00000330682 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.07■■■□□ 2.4
ELOA3-201ENST00000330682 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.01■■■□□ 2.4
ELOA3-201ENST00000330682 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
ELOA3-201ENST00000330682 NCAPD3P42695 1498 aa29.95■■■□□ 2.39
ELOA3-201ENST00000330682 HMGXB3Q12766 1538 aa29.92■■■□□ 2.38
ELOA3-201ENST00000330682 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.8■■■□□ 2.36
ELOA3-201ENST00000330682 TRIM41Q8WV44 630 aa29.46■■■□□ 2.31
ELOA3-201ENST00000330682 ABCC8Q09428 1581 aa29.4■■■□□ 2.3
ELOA3-201ENST00000330682 CFTRP13569 1480 aa29.31■■■□□ 2.28
ELOA3-201ENST00000330682 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
ELOA3-201ENST00000330682 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.17■■■□□ 2.26
ELOA3-201ENST00000330682 PRDM2Q13029 1718 aa29.17■■■□□ 2.26
ELOA3-201ENST00000330682 SYNJ1O43426 1573 aa29.1■■■□□ 2.25
ELOA3-201ENST00000330682 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.08■■■□□ 2.25
ELOA3-201ENST00000330682 TOP2BQ02880 1626 aa28.97■■■□□ 2.23
ELOA3-201ENST00000330682 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.95■■■□□ 2.22
ELOA3-201ENST00000330682 NESP48681 1621 aa28.92■■■□□ 2.22
ELOA3-201ENST00000330682 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.92■■■□□ 2.22
ELOA3-201ENST00000330682 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
ELOA3-201ENST00000330682 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.91■■■□□ 2.22
ELOA3-201ENST00000330682 CUX1P39880 1505 aa28.89■■■□□ 2.22
ELOA3-201ENST00000330682 SOGA1O94964 1423 aa28.85■■■□□ 2.21
ELOA3-201ENST00000330682 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.84■■■□□ 2.21
ELOA3-201ENST00000330682 EEA1Q15075 1411 aa28.77■■■□□ 2.2
ELOA3-201ENST00000330682 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.75■■■□□ 2.19
ELOA3-201ENST00000330682 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.66■■■□□ 2.18
ELOA3-201ENST00000330682 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.64■■■□□ 2.18
ELOA3-201ENST00000330682 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.6■■■□□ 2.17
ELOA3-201ENST00000330682 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.6■■■□□ 2.17
ELOA3-201ENST00000330682 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.58■■■□□ 2.17
ELOA3-201ENST00000330682 TOPBP1Q92547 1522 aa28.55■■■□□ 2.16
ELOA3-201ENST00000330682 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.55■■■□□ 2.16
ELOA3-201ENST00000330682 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ELOA3-201ENST00000330682 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.48■■■□□ 2.15
ELOA3-201ENST00000330682 KIF21BO75037 1637 aa28.43■■■□□ 2.14
ELOA3-201ENST00000330682 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ELOA3-201ENST00000330682 KIF27Q86VH2 1401 aa28.43■■■□□ 2.14
ELOA3-201ENST00000330682 GOLGA3Q08378 1498 aa28.37■■■□□ 2.13
ELOA3-201ENST00000330682 CUX2O14529 1486 aa28.35■■■□□ 2.13
ELOA3-201ENST00000330682 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.32■■■□□ 2.12
ELOA3-201ENST00000330682 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.32■■■□□ 2.12
ELOA3-201ENST00000330682 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.31■■■□□ 2.12
ELOA3-201ENST00000330682 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.31■■■□□ 2.12
ELOA3-201ENST00000330682 PRXQ9BXM0 1461 aa28.3■■■□□ 2.12
ELOA3-201ENST00000330682 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.26■■■□□ 2.11
ELOA3-201ENST00000330682 WDR97A6NE52 1622 aa28.25■■■□□ 2.11
ELOA3-201ENST00000330682 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.23■■■□□ 2.11
ELOA3-201ENST00000330682 IGF1RP08069 1367 aa28.2■■■□□ 2.11
ELOA3-201ENST00000330682 WDR62O43379 1518 aa28.19■■■□□ 2.1
ELOA3-201ENST00000330682 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
ELOA3-201ENST00000330682 ERCC6Q03468 1493 aa28.16■■■□□ 2.1
ELOA3-201ENST00000330682 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
ELOA3-201ENST00000330682 CEP162Q5TB80 1403 aa28.15■■■□□ 2.1
ELOA3-201ENST00000330682 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
ELOA3-201ENST00000330682 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.1■■■□□ 2.09
ELOA3-201ENST00000330682 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.03■■■□□ 2.08
ELOA3-201ENST00000330682 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
ELOA3-201ENST00000330682 GAPVD1Q14C86 1478 aa28■■■□□ 2.07
ELOA3-201ENST00000330682 CUL7Q14999 1698 aa27.98■■■□□ 2.07
ELOA3-201ENST00000330682 IFT140Q96RY7 1462 aa27.97■■■□□ 2.07
ELOA3-201ENST00000330682 CLIP1P30622 1438 aa27.91■■■□□ 2.06
ELOA3-201ENST00000330682 PBRM1Q86U86 1689 aa27.86■■■□□ 2.05
ELOA3-201ENST00000330682 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
ELOA3-201ENST00000330682 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
ELOA3-201ENST00000330682 GRIN2BQ13224 1484 aa27.77■■■□□ 2.04
ELOA3-201ENST00000330682 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
ELOA3-201ENST00000330682 ADAMTS12P58397 1594 aa27.71■■■□□ 2.03
ELOA3-201ENST00000330682 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
ELOA3-201ENST00000330682 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.69■■■□□ 2.02
ELOA3-201ENST00000330682 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.69■■■□□ 2.02
ELOA3-201ENST00000330682 ARAP1Q96P48 1450 aa27.69■■■□□ 2.02
ELOA3-201ENST00000330682 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.68■■■□□ 2.02
ELOA3-201ENST00000330682 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.67■■■□□ 2.02
ELOA3-201ENST00000330682 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108 ms