Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCSO14618 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCSO14618 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCSO14618 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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