Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms