Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRMT12Q53H54 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms