Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRYD3Q8NCJ5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRYD3Q8NCJ5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms