Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
U3KQE9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQE9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQE9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQE9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
U3KQE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQE9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQE9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQE9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQE9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
U3KQE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
U3KQE9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQE9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQE9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQE9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
U3KQE9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
U3KQE9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
U3KQE9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQE9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQE9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQE9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQE9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQE9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
U3KQE9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQE9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQE9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQE9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQE9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
U3KQE9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQE9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQE9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQE9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
U3KQE9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
U3KQE9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
U3KQE9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
U3KQE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
U3KQE9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
U3KQE9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U3KQE9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U3KQE9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U3KQE9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
U3KQE9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U3KQE9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U3KQE9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U3KQE9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KQE9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KQE9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KQE9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KQE9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KQE9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KQE9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KQE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U3KQE9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KQE9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KQE9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KQE9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms