Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX5Q9Y5X3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms